說起近代史，有一個人的名字繞不過去，這就是章太炎。近現代史上許多重大事件與他有著直接的關係，有些他甚至在其中是決定性人物。「中華民國」之名稱出自章太炎，「五色旗」是他提出的，身後他用「五色旗」結爻，而拒用青天白日旗。他曾被袁世凱和黎元洪兩任大總統授予「勳位」。而他與勳章的最有名的故事，是拿大勳章作扇墜，大罵袁世凱。此事當時曾登於《申報》和《時報》。
杭州西湖南屏山下有個章太炎紀念館。章太炎早年在西湖孤山下的「詁經精舍」從著名國學大師俞樾「曲園」求學，從23歲到30歲，前後七八年。他說話有餘杭口音，初聽有點聽不清，而且他愛吃江南霉字系列的菜：霉乾菜、霉冬瓜、霉筧菜梗、臭豆腐、臭花生……據說有個叫做錢化佛的畫家投他所好，用這些菜換走了他手書的一百多幅字，現在當然是寶貝了。
章太炎一生講學、著書、革命，門下弟子眾多，影響巨大。胡適也很敬重章太炎，評價他的古文學是五十年來第一人。1936年6月，在日本即將全面侵略中國前夕，他留下「設有異族入主中夏，世世子孫毋食其官祿」的遺囑黯然離世。他在《中華民國解》這篇文章中首創了「中華民國」這個名稱，所以當他死後，非常理解他的夫人湯國梨要用五色綢為他結爻，拒絕青天白日旗。
對於章太炎的評價，魯迅那段話說得最精闢：
考其生平，以大勳章作扇墜，臨總統府之門，大詬袁世凱的包藏禍心者，並世無第二人；七被追捕，三入牢獄，而革命之志，終不屈撓者，並世亦無第二人：這才是先哲的精神，後生的楷模。
這兩個「並世無第二人」就是這位章門弟子對老師的蓋棺定論。說章太炎「三入牢獄」，據現有史料我們只知道有兩次，一次是在上海租界因「蘇報案」被判刑三年，另一次是在北京被袁世凱軟禁將近三年。
轟動一時的「蘇報案」
先說他的第一次坐牢。他是個大學問家，卻喜歡談政治，到晚年還喜歡褒貶當世人物。早年他是改良派，在戊戌變法前就支持維新變法，做過上海《時務報》的編輯，遭到通緝而流亡日本。1902年，他與秦力山等人發起「支那亡國二百四十二年紀念會」，起草了一篇激動人心的宣言書，以後在留日學生中愛國團體紛紛出現，都是起源於這次亡國紀念會。
1903年，他在上海愛國學社教書，18歲的少年鄒容寫了熱情澎湃的《革命軍》一書，他慷慨作序，首先發表在《蘇報》上。他還寫下著名的《駁康有為論革命書》，為革命大唱讚歌：「然則公理之未明，即以革命明之；舊俗之俱在，即以革命去之。革命非天雄大黃之猛劑，而實補瀉兼備之良藥矣。」文中甚至直呼光緒帝之名，「載湉小丑，未辨菽麥」。
文章在《蘇報》節選發表，舉世嘩然，上海市上，人人爭購，清廷惱怒，認為他大逆不道。加上《蘇報》的其他言論，經清廷多次要求，上海租界工部局終於下令查封《蘇報》和愛國學社，逮捕章太炎、鄒容、《蘇報》老闆陳范等7人。巡捕來抓人時，其他人都聞風而逃，只有他一個人不逃，他認為革命就要流血，沒什麼可怕，清廷要捉他已經是第七次。他指著自己的鼻子對巡捕說：其他人都不在，要抓章炳麟就是我！他不僅自己不屑逃走，還在巡捕房寫信叫鄒容等投案。少年鄒容不願讓這位大哥一個人受難，就自動投案。這就是轟動一時、名垂青史的「蘇報案」。
章太炎在獄中還公開在報紙上發表慷慨激昂的文章：「吾輩書生，未有寸刃尺匕足與抗衡，相延入獄，志在流血，性分所定，上可以質皇天后土，下可以對四萬萬人矣。」
他在駁斥《新聞報》的文章中預言，五十年後，銅像巍巍立於雲表的將是他。有這樣的底氣，所以他才會在法庭上從容不迫，侃侃而談，為自己辯護，讓原告、堂堂的大清政府無言以對，因為官司是在租界的法庭會審公廨打的。他的主要罪名是「載湉小丑」四個字，載湉是光緒帝的名，他是那個時代造詣最深的文字學家，他說：所謂觸犯清帝聖諱，我只知清帝是滿人，不知道什麼聖諱，「小丑」在漢語中本來是「類」字或「小孩子」的意思，並不是什麼譭謗。
這是36歲的章太炎和18歲的鄒容進入歷史的日子，以指控罪名之大，他們從沒想到會活著出來。當時指控他們的罪名是：「大逆不道，煽惑亂黨，謀為不軌」。章長髮披肩，穿的衣服不東不西，很像是僧人袈裟。鄒容剪掉了恥辱的辮子，穿西服。庭審完畢，他們坐在馬車上回捕房，上海街頭萬人空巷，一路上章太炎大聲念詩：「風吹枷鎖滿城香，街市爭看員外郎。」
清廷一開始一心想致他們於死地，要把他們兩個引渡過來，自己來審判。可是在租界擁有治外法權的外國人不買賬，他們有他們的規則。在他們看來，章、鄒不過是言論得罪朝廷，是國事犯，並沒有那麼嚴重，不同意交給清廷處置。經過兩個多月翻來覆去的討價還價，清廷最後放棄了引渡的努力。
章太炎、鄒容請的外國律師都為他們做了無罪辯護，說他們是年輕學生，出於愛國熱忱，並無謀叛之意。這大概是中國歷史上第一次有律師出庭為被告的政治犯辯護。在他們被捕10個月後，會審公廨終於作出判決，章太炎監禁三年、鄒容監禁二年，期滿驅逐出境，不准留在租界。
這個案件實際上代表了當時排滿的一種民族情緒，象徵意義特別大，章太炎因此博得大名。此案對於辛亥革命的影響極為深遠，章太炎所代表的革命言論影響所及，從地域上看，由上海擴大到整個長江流域。從對像上看，由下層階級普遍到知識階級，因為章太炎的國學深湛，世人共知。這對於後來革命成功關係極大。特別是「蘇報案」，章太炎、鄒容以區區個人和大清朝廷打官司，這是清朝以來前所未有的事。清廷雖然勝訴，章、鄒不過囚禁兩三年而已，民氣為之大壯。這是孫中山後來的評價。
在獄中，章太炎、鄒容被罰作苦工，經常遭到拳打腳踢，章太炎為了抗議曾經絕食七天，他從佛經中尋找解脫之道。鄒容因為憤激交加，病倒了，刑期不到三個月時死在獄中，只有20歲。1906年6月底，章太炎刑滿獲釋，孫中山派人專程從日本趕到上海接他出獄，當晚就東渡日本。他加入同盟會，並主持機關刊物《民報》，寫了一系列有戰鬥力的文章，用魯迅的話說那真是「所向披靡，令人神旺」，「戰鬥的文章乃是先生一生中最大、最久的業績」。
袁世凱最怕的兩支筆
辛亥革命後，章太炎從日本回國。
辛亥革命前，章太炎和陶成章等人因為和孫中山意見分歧，重組光復會，以章太炎擔任會長。辛亥革命爆發後，1911年11月章太炎返回國內，接近同盟會的《民立報》專門發表社論《歡迎鼓吹革命之文豪》：「章太炎，中國近代之大文豪，而亦革命家之鉅子也。正氣不滅，發為國光，文字成功日，全球革命潮……」呼籲同胞將章太炎看作是「新中國的盧梭」。
他和宋教仁、黃興等聯名發表了很多有關時局的通電，發揮過積極的作用。他還提出過「革命軍起，革命黨消，天下為公，乃克有濟」的口號，反對「以一黨組織政府」。
孫中山被推為臨時大總統，據說他最初提出的南京臨時政府內閣名單中，本來是以章太炎為教育總長，因為遇到同盟會內部的反對，才改為蔡元培。章太炎創辦了有名的《大共和日報》，發揮了有力的輿論影響，對孫中山及其南京臨時政府有許多的不滿與批評，他為四川烈士追悼會送去一副輓聯：
群盜鼠竊狗偷，死者不瞑目；此地龍蟠虎踞，古人之言虛。
這副流傳後世的輓聯表達了他對南京臨時政府的不滿。也就是這個時候，章太炎發起組織了中華民國聯合會、統一黨、共和黨等政治團體，與黎元洪交好，一度還對袁世凱抱有幻想。書生氣十足的章太炎恐怕想不到，袁世凱等正是要利用他與孫中山一派的不和，坐收漁翁之利。1913年5月袁世凱為了籠絡他，授予他勳二位（「二等勳位」），對此，他是不滿的，他的自我評價是八個字：「首正大義，截斷眾流」。
章太炎認為自己的言論鼓吹之功要在孫中山之上，而且他與黃興、孫武、段祺瑞、汪精衛等五人論功都高於孫中山（後來黎元洪當總統時授予他大勳位）。袁世凱先是給了他一個總統府顧問的空銜，然後，給了他一個空頭的東北籌邊使，無錢無人。他曾經發電報給袁，要求撥款三萬，很久沒有回音，他生氣了，給袁政府發了個有名的十字電：「只管推宕不要你的錢了。」
堂堂國學大師，文章深奧，這次一生氣，發了這個白話的十字電，還在上海《新聞報》上發表，實際上是一次公開抗議。時間在3月25日。這時宋教仁被暗殺的消息已傳到東北，南北即將破裂，刀兵再起，章太炎辭去東北籌邊使的職務，毅然南下，孫、黃和陳英士等大為歡迎，稱其為「革命先覺，民國偉人」。章太炎在國民黨舉行的歡迎會上也表示：「共和黨與同盟會雖時有小嫌，百年宜思大義」。
不過，他發表反對袁世凱的宣言，對於將全部罪行歸於袁不以為然，只認為袁身邊梁士飴等「四凶」、「七奸」可殺。
等到「二次革命」失敗，大家勸他去日本，他拒絕流亡，反而冒險入京，結果被袁世凱軟禁（袁曾對身邊人說過，他怕兩支筆，一是梁啟超，一是章太炎），直到1916年6月袁死後才獲得自由。入京前，他剛剛和湯國梨新婚不久。
連婚姻都與眾不同
這個特立獨行、不按常理出牌的人，他的婚姻也是與眾不同。
章太炎25歲的時候，母親給他娶了個妻子，姓王，他總是不承認是妻，所有文字都寫作「妾王氏」。他與王氏有三個女兒，沒有兒子。這個精通文字學的國學大師，連給女兒起名字也要顯示學問，不查字典，我們可能一個字也不認識。
1903年，也就是「蘇報案」前夕，他的第一任妻子在故鄉餘杭病故。這一年他36歲。以後過了10年的單身生活。很多人勸他續絃，給他提親，問他有什麼條件，他的回答是：「人之娶妻當飯吃，我之娶妻當藥用」。他對上一次父母之命、媒妁之言的舊式婚姻很厭惡，所以破天荒地在報紙上登廣告公開徵婚，他的《徵婚告白》中對擇偶共有五條要求或者標準：
一是限湖北籍女子；
二是讀過書，文理通順，能作短篇文字；
三是屬大家閨秀；
四是雙方平等，互相尊敬；
五是不要纏足女子。如丈夫先死，可以再嫁；若夫妻不和，可以離婚。
這個五條，後面四條都容易理解，只有第一條令人納悶。
他自己解釋擇偶標準時說：「兩湖人甚佳，安徽人次之，最不適合者為北方女子。廣東女子言語不通，如外國人，那是最不敢當的。」他為什麼會認為「兩湖人甚佳」？兩湖當中為什麼又更限定湖北人？他沒有說。據說，他曾看上過一位畢業於女子學校的湖北籍大家閨秀，叫做吳淑卿，有人對他講，吳也愛上了他，此事雖然沒有結果，但因為這個緣故，他對湖北女性有了特別不尋常的好感。
刊登徵婚廣告在我們今天是稀鬆平常的事，在當時卻是驚世駭俗之舉，引起了軒然大波，被許多人看作荒誕，雖然章太炎名聲在外，很長時間也沒有一個人前來應徵。符合條件的大家閨秀肯定接受不了這種越軌的徵婚方式。
直到1913年，經朋友介紹，44歲的章太炎與31歲的湯國梨在上海結婚，這則開創先河的徵婚廣告才算作廢。湯女士和《徵婚告白》中的五項標準中後面四條基本符合，只不過她是浙江人，不是湖北人。不知道章太炎是不是為這一點感到有些遺憾。章太炎找老婆有5條件，要湯嫁他，她還覺得為難呢。她說章太炎有三點不合她的要求，讓她猶豫。
她說：「一是其貌不揚，二是年齡太大（比她大十三歲），三是很窮。」
可是，她想到章太炎為了革命，早在清朝統治下就毅然剪掉辮子，而且為革命坐牢，辦《民報》宣傳革命，他的精神骨氣、淵博學問都非庸庸碌碌之輩可比。她想在婚後可以在學問上隨時向他討教，所以才同意婚事。
湯國梨是浙江桐鄉烏鎮人，茅盾的老鄉，不過出生在上海。父親是個普通的讀書人，她9歲那年就去世了，回到烏鎮，在親戚接濟下長大。從小就會寫詩填詞。而且幫母親料理家務，針線活、種花除草都拿得起。23歲那年（1905）在舅舅支持下，進入上海新式學堂務本女學讀書，同學中有張謇等名流的女兒。她在務本女學不僅成績出眾，而且積極參加社會活動，比如保路拒款運動，上街演講。1907年夏，她從務本女學師範畢業。回浙江私立吳興女校教書，在這裡工作四年，後來做了校長。辛亥年秋天，她辭職準備到上海辦學，武昌起義的消息傳來，她興奮地寫下這樣的詩：「莫道秋光多肅殺，經霜紅葉爛於花。」
她和老同學張默君參與發起有名的「女子北伐隊」，她出主意組織遊園會，3天內募集到5萬元經費。攻破南京，孫中山建議她們做教育和宣傳工作，她們就用這筆錢辦了神州女學和《神州日報》，她做教師又做編輯。1913年她已經30歲，這年春天，經同學張默君的父親張通典（做過孫中山的秘書長）介紹，他和章太炎有了婚姻之約。
1913年6月15日，他們的婚禮在上海有名的哈同花園舉行。男女來賓有孫中山、黃興、陳英士等共二千多人，各界要人與知名人士雲集一堂。證婚人是蔡元培先生，證婚書卻是由章太炎自己用典雅深奧的古文寫的，今天看來有點文縐縐、酸溜溜。什麼泰山之竹、南國之桃，還有「松柏後凋，貞干無移於寒歲」等句子，國學大師的證婚書畢竟不同一般人。
當天晚上，章太炎與湯國梨二位，在「一品香」舉行了婚宴，酬謝嘉賓。酒席上，賓客們要求新人即席賦詩，而且以20分鐘為限，章太炎即席吟了一首五言詩，詩中把自己比做像稗草一樣的小草，卻把湯女士視為天人，得到賓客尤其女賓的讚賞。湯國梨女士也當場揮毫寫下一首舊作《隱居詩》，詩比章太炎寫得好，意境高遠脫俗，淡泊飄逸，有大家風範。在來客中傳看，引得眾口一詞的讚美聲。只，她與頂級文化名人結婚後，夫唱婦隨，她的「隱居」夢再也做不成了。他們雙雙回餘杭掃墓、省親，度蜜月。
另外有一種說法，章太炎在東北回到上海，孤身一人，生活無人照料，所以在北京、上海幾家報紙上刊登求婚廣告，廣告內容很簡單，只對「對像」提出三條要求：
一、須文理通順，能作短篇文字；
二、須大家閨秀；
三、須有服從性質，不染時下習氣。
這三條中有兩條和前面相同，只是最後一條多了大男子氣味，還是男尊女卑。流傳更廣的是前面五條，也更可信。
湯國梨萬萬沒有想到，她們結婚不滿一個月，還在蜜月當中，「二次革命」爆發了，而且很快失敗。孫中山、黃興等再度亡命日本，章太炎不僅不走，反而要北上身入險地，當面去責問袁世凱。湯勸他：袁世凱怎麼會輕易放過你？他回答：「事出非常，我志已決，卿毋多慮。」匆匆離去。
特立獨行的「章瘋子」
章太炎是一介書生，一個傳統的讀書人，一個特立獨行的學問中人。正因為如此，他才會踏上反清之路。也正因為如此，到了1913年8月，他才會冒險入京，結果被幽禁將近三年，他仍嚴詞拒絕為袁世凱稱帝上表勸進以換得人身的自由。
「時危挺劍入長安，流血先爭五步看。」這是他當時寫下的詩句，其實他手中哪裡有什麼劍，有的不過是一支筆，和書生的天真、骨氣，正如他寫給負責看管他的憲兵副司令陸建章信中所言，他在旁人紛紛逃避南下之時反其道而行，僅僅是因為：「余本光復前驅，中華民國由我創造，不忍其覆亡，故來相視耳。」
他被軟禁在北京，每天都要寫大字「袁賊」、「袁賊」，他在牆壁、窗紙上都寫了這兩個字。有時也寫「袁棍」。他喝酒時，吃花生米，一面去掉花生蒂，大罵：「殺了『袁皇帝』的頭！」
關於他「以大勳章作扇墜，臨總統府之門，大垢袁世凱的包藏禍心」，當時的《申報》有過公開的報道：有一天穿藍布長衫的章太炎手拿團扇一柄，團扇下面繫著大勳章，腳上穿了一雙破官靴，在總統府院子裡瘋言瘋語，大罵袁世凱，大鬧不休。《時報》的題目就叫《章炳麟大鬧總統府》。
這是他一生中繼「蘇報案」拒絕逃走、「風吹枷鎖滿城香」之後又一個經典鏡頭，章太炎的形象也由此而永遠鮮活。
章太炎被軟禁，對湯國梨打擊可想而知，她連忙派人到故鄉餘杭和族人商量營救辦法。結果帶回來的消息你們猜是什麼：「族中已決定將他開除出族。」
袁世凱還千方百計誘迫她也進北京，為了達到長期軟禁章太炎的目的，他想把章的家眷接過去。所以，常常有自稱章門人或至友來看她，或者問通訊情況，或者表示願代遞秘密文件，貌似慇勤。她和章太炎結婚不久，並不認識他的門人、至友，也沒秘密文件要寄。《大共和日報》、《神州日報》幾個人多次來找她，說章先生已得到當局諒解，還要出任要職，車馬洋房都已準備就緒，先生也樂於接受，當局必須要家屬到京，才能成事，所以望夫人早日成行。袁世凱之所以要她北上，就是要斷了章太炎南歸的念頭，而且掩蓋了自己軟禁章太炎的惡名。而且她參加過革命，又和陳英士有同鄉之誼，袁對她也並不放心。
既然北上無益，反而可能中了袁的計算。她堅持不北上。每次寫信給章太炎，她總是勸他不要以家屬為念。兩人在三年中書信往還不斷，她多次寫詩寄托相思，安慰丈夫。為了生計，她先後到湖州陳英士等人家裡當家庭教師。湯夫人給袁世凱寫了一封信，措辭得體，不亢不卑，說到自己與章太炎的結合，她有八個字：
「結褵一年，誓共百歲。」
袁世凱先是把章太炎軟禁在共和黨黨部的一間小屋裡，再移到龍泉寺，後來又轉到錢糧胡同。到龍泉寺的第二天派長子克定親自送被褥來，都是當時最好的錦緞，他不見。而且把這些東西燒了、扔了。章太炎經常發脾氣，罵人，砸碎器物，揚言要放火燒房子，還幾次絕食抗議。原來是袁給憲兵頭子陸建章下了保護章太炎的手條，共八條，很細緻：
一、飲食起居用款多少不計；
二、說經講學文字，不禁傳抄，關於時局文字，不得外傳，設法銷毀；
三、毀物罵人，聽其自便，毀後再買；
四、出入人等，嚴禁挑撥之徒；
五、哪個人與他關係密切，又不妨礙政府的，任其來往；
六、早晚必派人巡視，防止出意外；
七、求見者必須持許可證；
八、保護全權完全交給你。
陸建章說自己奉了袁世凱的命令，無論先生的性情如何乖僻，都必須敬護他。否則我們連黃巾軍都比不上了。「章太炎就是當今的鄭康成，當年黃巾軍過鄭公鄉避開。」
另有一種說法，袁世凱也想過要把他殺了，陸建章勸說：「太炎先生不可得罪，用處甚大，他日太炎先生一篇文章，可少用數師兵馬也。」
第三個版本是幕僚阮忠勸說袁世凱，武則天讀了駱賓王的檄文還讚歎是個人才，燕王朱棣挨了方孝儒的罵，也不想殺方。章太炎的文章學術，不可多得，無罪加以殺戮，公的智謀難道還不如武則天、燕王嗎？袁世凱聽了哈哈一笑，自我解嘲：「他一個瘋子，我何必與之認真。」不久，又將章太炎遷居到錢糧胡同。他不想擔殺士的惡名。所以，無論章太炎怎麼鬧，都不殺他，容許他和家人通信，通信雖然要經過檢查，但他寫的家書中罵袁世凱沒有奸雄氣象，不過是腐敗官僚的頭頭。說袁連曹操都比不上。這樣的信居然都通過了。袁還容許他講學，學生最多的時候有上百人。
後來湯夫人將章太炎那三年中寫的家書印了一本，共84封，只有二封給三女兒，82封是寫給她的，都寫得情致纏綿，古板的國學大師原來也是多情種子。袁世凱死後，他終於回到上海，受到盛大歡迎。他們夫婦回餘杭老家掃墓，在杭州也受到盛大歡迎。把他開除出族的章氏族人紛紛前來道賀，湯依然以禮相待。1916年元宵節，吃晚飯時，他夾起一個湯圓對陪同他的長女、小女和長女婿等人說：「湯圓又稱元宵，元宵者，袁消也。」
然後把湯圓吞下去。沒有多久，袁世凱就報銷了。袁說他是一個瘋子，在民國初年，他確實有一個「章瘋子」的綽號。
其實章瘋子並不瘋，只是特立獨行罷了。
毋庸諱言，章太炎也有缺點，有士大夫式的習氣，比如好名，喜歡恭維，愛隨意臧否人物，事事要挑剔等。辛亥革命期間，他一度被「意氣用事」的一些少年包圍。受梁啟超之命多次拜訪過章太炎的盛覺先在寫給梁的信中說，聽說章太炎左右幾個人，囂張浮華，專事阿諛，以為太炎奇貨可居，挾章太炎而自重，而章太炎似乎為他們所蒙蔽，並不知情。
魯迅回憶，民國元年，章太炎先生在北京，好發議論，而且毫無顧忌地褒貶。常常被貶的一群人於是給他起了一個綽號，曰「章瘋子」。他的瘋子之名由此而來。
生活中的「瘋子」很有趣
章太炎平時心思放在學問上，生活上有點弱智。早年在東吳大學教書，住在一間租來的小屋，早出晚歸，回家時常常忘記自己的門，走到鄰居家去了，還不知道。他喜歡穿奇裝異服，招搖過市，「蘇報案」時穿的那件衣服不僧不俗，有點像袈裟。章太炎紀念館還保存著一件夏天穿的背心，是竹子編的，夏天穿了涼快。他以大勳章作扇墜，大罵袁世凱，也被一些人看作「瘋子」。早在日本黃興就曾經稱他是「瘋子」。民國初年有「三大瘋子」之說，都是國學大師，一個是章太炎，一個是劉師培，另外一個是章門大弟子，被稱作「黃瘋子」的黃侃。
章太炎的一生維新、革命，親自參與創建了亞洲第一個共和國，又親眼看到所謂的民國只不過是軍閥們的裝飾品，從袁世凱到蔣介石，政治舞台上大大小小的軍閥走馬燈一樣上演著一出出武戲。他的晚年，湖南軍閥趙恆惕請他去「主考縣官」，孫傳芳請他「主持授壺」，吳佩孚想要請他當「總參贊」。魯迅說他「既離民眾，漸入頹唐……但也不過白圭之玷，並非晚節不終」。
終其一生他還是一個做學問的人，他把畢生精力獻給了波瀾壯闊的革命運動和源遠流長的民族文化。五四時期，北大那些有名的教授，大多出自他的門下，如黃侃、錢玄同、朱希祖、沈兼士、馬幼漁、周作人、沈兼士、劉文典，還有兼職的魯迅等人。章太炎曾經對人說，他門下有五大弟子，可以比太平天國的諸王，黃侃是天王，汪東是東王，朱希祖是西王，吳承仕是北王，錢玄同是翼王。合稱「章門五王」，只是缺了一個南王。有人問章太炎為什麼封錢玄同為翼王？章回答：因為他常常喜歡造反，鬧獨立。原來錢後來成了今文學派，章還是古文學派。五大弟子個個國學深湛，名重一時。
直到他晚年還在蘇州辦「章氏國學講習會」，講小學、經學、史學、諸子和文學，還專門講過《尚書》、《說文》等。他每次講完一門課，學生就會將聽講記錄整理出來，他因為精力不逮，付印前不能親自審校，所以他堅決不同意在聽課記錄上署名。
當章太炎滔滔不絕的時候，總是煙不離手，一支接一支，裊裊如縷，每當手邊的煙吸完了，他就會大聲地喊：「老李，取煙來！」他的嗜好就是抽煙，常常一支還沒完，還有一寸，他又點一支，三四個小時接連抽煙，晚年也是，抽的是當時上海流行的美麗牌，偶爾抽白金龍，就是珍品了。他給人寫字一般不受錢，而是收香煙，所以綿綿不絕。最有意思的是他的兒子七八歲時，看見父親常常為人寫字，就貼了一張紙：寫一副對聯皮球一個，條幅一張，火車頭一個（玩具）。別看他幼稚，問的話，讓客人驚訝，比如他會問他爸爸：「商務印書館的百衲本二十四史還沒有出齊嗎？」
章太炎寫字常常是鐘鼎文，很古雅的，寫字的時候，他喜歡一個人。有時湯夫人站在後面，說某個字寫得不佳。他會回頭笑笑：「你不懂得寫字囉！」其實湯不僅詩好文好，而且字也寫得端秀，更重要的是深深理解章太炎。
用五色綢為他結爻的原因
民國之前，章太炎和孫中山的分歧就已經很明顯了。民國之後，陳英士不僅安排刺殺陶成章，對章太炎的攻擊也沒有停止過。
1912年3月的一天，章太炎收到一封來自南京臨時政府的匿名電報，內容是說章太炎主張建都北京，有功於袁世凱，袁要給他教育總長或最高顧問之職，請他速進京陛見云云。章太炎詰問南京政府，孫中山有回復。後經電報局查實，發電時「確有內務部印信」。同盟會內部有人說章太炎反對同盟會，還要暗殺他。章太炎每當想起陶成章被殺後，黃興馬上致電陳英士保護他，不免有些激動。
從1912年5月到6月，孫中山的忠實追隨者、以激進著名的戴天仇（季陶）不斷地在《民權報》對章太炎破口大罵，從《哀章炳麟》、《該死的章炳麟》、《殺》、《章炳麟非人》、《水性楊花之人妖》這些題目就不難想見其內容。其中認定章太炎最大的罪過就是「運動各界排斥同盟會」、在袁世凱面前「力詆孫、黃」、要求取消南京留守府等，所以指責章「阿權」、「朝東暮西」、「偽詐百出」。
史學家張玉法先生分析：「章炳麟所以組統一黨與同盟會抗，是起於對南京臨時政府權力結構的不滿，而武昌革命爆發後，同盟會人對光復會的打擊與冷落，亦早已促使章炳麟的離心。」張繼回憶：「舊同盟會因政見之不同，已分數派，加入民社者有之，加入統一黨者有之……因陶煥卿（成章）光復會之關係，浙江亦與武漢接近，而疏南京。」大致上合乎事實。
因為民國初年複雜的政治鬥爭中，親密同伴陶成章被暗殺，章太炎終生都罵蔣介石是殺人兇手。1927年6月，國民黨上海特別市黨部發出「通緝著名學閥章炳麟」令，1928年11月，又呈請國民黨中央通緝他。當然蔣介石沒有這麼傻，把一個對自己權力沒有威脅的章太炎抓起來。
當章氏國學講習會開辦不久，國民黨中央委員丁惟汾前來蘇州代表國民黨中央慰問章太炎，他們曾是同盟會的老友。這是老蔣要拉攏元老，收買人心。丁臨走時留信一封，裡面夾了萬元支票一張，說是給他治病用的。章太炎是不肯接受蔣的錢的。那怎麼辦呢？如果拒絕，會讓蔣難堪，也會惹禍。這時，湯國梨想到了一個兩全其美的辦法——
我們明天登個報，聲明將這一萬元用於國學講習會，作為助學金。凡是困難學生都可以享受免費的教育。
章太炎為此拍案叫妙。第二天，他們登報聲明，國民黨中央送的醫療費全部作為助學金。這樣就巧妙地應付過去了。
1936年6月，在日本即將大舉侵略中國前夕，章太炎留下「設有異族入主中夏，世世子孫毋食其官祿」的遺囑黯然離世。他死後，按照他故鄉餘杭的風俗，要在棺材內用綢覆蓋，並將綢子打成結，叫做結爻。一般都用一種顏色的綢子。非常理解他的夫人湯國梨卻買了五種顏色的綢子，紅、黃、藍、白、黑。她將這五種顏色按五色旗的順序排列在棺內，就是用五色綢為章太炎結爻。
她說：「太炎先生為辛亥革命勝利，為五色旗的誕生，出過力，坐過牢，而沒有為國民黨旗效過什麼勞，因而用五色綢為他結爻，最為恰當。」當時，國民黨當局有意為章太炎舉行國葬，國民政府發佈了一個「國葬章太炎令」，其實沒有下葬，靈柩一直停在蘇州家中的園子裡。所謂國葬令只是一紙空文。如果當時真的國葬，那就必須用青天白日滿地紅旗。用五色旗當然要得罪蔣。
章太炎有個心願，想埋骨在南屏山下，與抗清名將張煌言（張蒼水）的墓為鄰，他仰慕張煌言，曾經說過：「生不同辰，死當鄰穴」。他在那篇有名的《支那亡國二百四十二年紀念會書》中就重點提到了張煌言。
埋骨西湖的這個遺願一直到1955年才完成。周恩來說章太炎是一代儒宗、樸學大師，學問與革命業績赫然，是我們浙江人民的驕傲。這個地方現在是章太炎紀念館，他的故鄉也以「章太炎故里」而驕傲。「蘇報案」發生後，他在獄中預言五十年後銅像巍巍立於雲表，可以說完全實現了。