「兩蔣」行館廣義而言大致可分為四類，不過有時雖歸類為行館，但蔣介石或蔣經國可能只會用到其中幾間廳捨，或經過時沉思休憩的地方，未必會因此把整棟建築徹底封閉，不能一概而論。
第一類是蔣介石父子長期定居的官邸，如士林官邸、草山行館、中興賓館、慈湖賓館、七海官邸等。這些駐所雖是官邸，但對比「兩蔣」胸懷，把這些在台寓所視為行館並不過分。由於「兩蔣」都習慣在官邸接見訪賓，商議大事，因此這類寓所不但有相當濃厚的政治象徵意義，周圍戒備與崗哨也異常森嚴。
第二類是專為蔣介石巡行、避暑而興建、改建的處所，像日月潭涵碧樓、澄清湖澄清樓、角板山貴賓館、福壽山達觀亭、澎湖第一賓館等。風光明媚、散居各地是這類行館的特色，大多數這類行館也都是沿襲自日據時代權貴所遺留的皇族住所。但由於兩岸情勢緊張，因此蔣介石也特地選擇幾處行館加強各類應變規劃與避難設施，甚至設有臨時指揮所，以應付突襲或轟炸等緊急事故。
第三類是蔣介石巡行時，地方政府或相關單位提供的臨時休憩處，這也是「兩蔣」行館中數量最多的一類。像八卦山行館、嘉義農場行館、棲蘭行館，或是中橫沿線許多處所，蔣介石可能只到過當地一兩次，甚至從未涉足，但地方人士或政府官員都打著「總統行館」的招牌，希望增加影響力，甚至因此禁止公眾使用或窺探。
第四類則是蔣介石平日重要辦公處所周邊暫時休憩地點，此類處所雖有行館性質，但因涉及蔣介石行程規劃安排與戒護需要，因此較為隱秘而不為人知，相較之下，他卻比較常在此逗留。
例如，陽明山中山樓作為「國民政府」重要的接待外賓地點，又是「國民大會」會場，外圍就有不少據點讓蔣介石開會前暫時休憩，甚至泡個溫泉舒緩身心。木柵「革命實踐研究院」（中興山莊）是國民黨培養幹部的重要場所，據說山莊內也有一處給蔣介石暫歇的行館，名為「木柵別館」或「草廬」；草廬東邊有座漂亮的「萃湖」，一說蔣介石與宋美齡還曾在此泛舟。
又如「總統府」旁、目前台灣「北美事務協調委員會」所在地的「博愛賓館」，據聞當年是蔣介石或宋美齡午間休憩場所，同時由於當時圓山飯店並未改建，因此包括顧維鈞、蔣廷黻、孔祥熙、宋子文等人抵台，都曾在此短暫居住，也是蔣介石定期召開主持「宣外小組」會議的地點。