馬雲的阿里系一直雄踞電子商務老大的地位，京東則像突然殺出的一匹黑馬，和馬雲較量。兩家紛爭不斷，他們之間的「戰爭」一次比一次慘烈，誰能笑到最後，拭目以待吧。
眾所周知，支付寶是電子商務支付的工具，淘寶100%的交易都是通過支付寶進行的，這是馬雲推動淘寶成為未來電商領域王者的核心產業。據易觀國際發佈的報告稱，2010年中國第三方支付市場交易額達到11324億美元，支付寶就占49%的份額。除了淘寶和阿里巴巴，其他使用支付寶的客戶已達到46萬家。2011年5月26日，支付寶成為首批獲得央行發放的《支付業務許可證》的27家單位之一。
2011年5月18日，劉強東透露消息：「明年京東使用支付寶要比使用其它支付方式多付500萬～600萬元費用……京東90%的貨物都是貨到付款，在線支付只佔10%，並且第一大是快錢，而非支付寶，支付寶只佔總銷售額的1%～2%，(放棄使用支付寶)對京東影響很小。」
2011年底，劉強東在考慮2012是否續用支付寶之前，曾給馬雲打過電話，表示京東作為支付寶的大客戶，能否降低費率，畢竟電商賺錢不容易，千分之三的費率太高。馬雲在電話裡的意思是「想辦法促成這件事。」隨後雙方溝通的結果卻出乎劉強東的意料：支付寶決定維持3%的利率不變。給出的解釋是「不能破了行規。」
有人傳出消息，是支付寶管理層否決了馬雲的建議。劉強東卻覺得，在阿里巴巴，沒有馬雲搞不定的事。由此得出的結論是：馬雲不仗義。如果馬雲採納了劉強東的建議，以京東交易300億元計，可節省費率是3000萬元。然而，對於京東與劉強東而言，更擔心支付寶收集京東商業機密，包括總交易量、單品類交易量、交易量的高峰與低谷。支付寶與天貓商城同是阿里系企業，把這些數據提供給天貓商城，會成為天貓商城對付京東的依據。劉強東覺得，支付寶是個攝像頭，還是對手的攝像頭，會扮演「無間道」。
京東棄用支付寶後，和銀聯合作推出新的支付工具。由此，劉強東和馬雲結下了樑子。
棄用支付寶只是一個現象，兩家最根本的衝突是京東與天貓商城要爭做B2C行業的老大，馬雲與劉強東要爭做電商行業的老大，劉強東不願讓京東成為對手賺錢的工具。
在京東宣佈棄用支付寶的當天，支付寶發表聲明：「尊重並理解京東這一商業決定……鑒於雙方目前尚在合約期內，支付寶仍會繼續為京東的用戶提供支付寶付款服務。」
事實上，京東從2011年6月就已經停止使用支付寶了，而合約是截止到8月。
京東徹底棄用支付寶，兩家分道揚鑣後，支付寶和京東的對手蘇寧易購打得火熱。
一個是電商老大，一個是電商新星，馬雲和劉強東短兵相接「大打出手」，競爭風起雲湧，這種競爭已經達到白熱化了，比價格戰更進了一步。誰主沉浮？人們拭目以待。
競爭不可避免，競爭是最有力的激勵。電商們如何從爭鬥中走出來，彼此合作，劉強東在與競爭對手的無數次交鋒中發出呼喚：不能整日盼著競爭對手死掉，完善自己，萬紫千紅才是春。
商家之間的競爭向來慘烈，電商也不例外。自從京東闖進電商領域後，淘寶掌門人馬雲一直盯著劉強東，兩代「電商之王」打得著實熱鬧。
眾所周知，馬雲的淘寶網當時拆分為三家公司，形成三足鼎力。淘寶網旗下的一淘商品搜索是淘寶網提出的一項全新的服務，其職能是利用淘寶豐富的產品和資訊這一優勢，解決用戶在購前和購後遇到的各種問題。
2011年10月24日下午5點30分左右，劉強東在微博上發佈一條消息，指責某公司擅自抓取了京東的客戶評價信息：「一家網站未經我們允許直接抓取我們所有的產品評價，這些產品評價是京東花費了價值過億的積分激勵用戶寫出來的，你怎麼也要打聲招呼吧？實在難以相信這是一家整日倡導『新商業文明、誠信』的公司所為，這和雞鳴狗盜行為有何分別？」
雖然劉強東沒有點名道姓，一淘網卻立即承認是己所為，並理直氣壯地表示，這是尊重互聯網公開透明的精神。更有甚者，一淘網通過官方微博反擊說：「此前您說費率過高停用支付寶，我們沒說什麼，您又說一淘抓取評價信息，作為購物搜索，一淘就是要讓互聯網透明給消費者實惠，新商業文明和誠信您不信但我們信，市場競爭必然讓消費者有更多選擇。」後來，劉強東刪除了他之前發佈的微博，不再做任何回應。當晚9點鐘左右，京東技術人員通過技術手段屏蔽了一淘網，一淘網的網絡蜘蛛再也無法抓取京東的客戶評價信息了。
劉強東使用了當年馬雲對付百度李彥宏的手法，屏蔽了對手的威脅。劉強東認為，一淘搜索抓取京東的用戶評價後，完全可以利用搜索的比價來分流京東的客戶，或者鉗制京東客戶流量入口，上演赤裸裸的電商行業價格競爭，使一淘成為超級電商門戶。劉強東必須在一淘用戶習慣未培養起來之前拒絕一淘。
京東屏蔽一淘網一事成為電商們屏蔽一淘的導火索。不久，當當網和蘇寧易購也加入了屏蔽一淘網的陣營。與此同時，有微博消息稱，包括國美網上商城在內的500家網站與一淘網建立合作，同一淘簽訂了合作協議，加入了一淘網的「一賬通」體系。一波未平一波又起，一淘網繼而採取分化瓦解的手法收服電商們。2011年9月28日，一淘網發表言論：「我們願意和當當、蘇寧展開合作商談。」對於京東，一淘則表示：「京東的評論我們已經停止抓取，但一淘將會繼續在網頁上保留京東的商品價格信息。」
劉強東警覺起來，忍無可忍的他直接把矛頭指向了馬云：「信息透明、為用戶服務？這種騙人的鬼話已經沒人信了，早晚誰給錢誰就排在前面，別想得到公平的信息。這只會加重電商的負擔，最終還是消費者買單！」馬雲諷刺劉強東：「我不看好這種低價買來東西，然後在網上高價賣出去的模式。」
競爭彷彿是電商們的家常便飯了，也難怪，有電商的地方就有競爭，市場經濟就是如此。
2011年的秋天，原淘寶商城更名為「天貓」。天貓成為將眾多獨立開店的商家聚合起來的開放平台，天貓宣佈：邀請1號店、樂淘、銀泰網、庫巴網等38家垂直B2C電商企業入駐天貓開旗艦店，京東不在邀請之列。對此，天貓總裁張勇說：「京東要符合天貓兩個條件，才能進駐天貓開旗艦店：重新啟用支付寶和停止只為銷售額不惜虧本的競爭模式，如果不能滿足這兩個條件，一切免談。」
面對張勇的這一說法，劉強東微微一笑，不予理睬。京東擁有自己的B2C平台，並針對電子商務的特點進行定制研發，使其在短短的幾年內迅速崛起。劉強東通過微博已經對網絡推廣和炒作的竅門熟之又熟了。他在2012年擴充了京東公關團隊的規模，加大了廣告的投入力度。
商場從來不缺乏競爭，激烈的競爭會推動商務的進步和發展，京東和淘寶作為B2C電商領域雙雄，他們對決的結果將決定當前行業格局。
劉強東說，競爭對手都是朋友，京東只有修煉內功，才能戰勝競爭對手，走到最後，笑到最後。
2011年10月10日，天貓推出了2012年度商家招商續簽及規則調整公告，按照此公告規定，進駐天貓的所有商家需在年底拿出比以往多出10多萬元的資金給天貓。這一地震性的消息立即引起軒然大波，天貓的擠壓，導致眾多小賣家難以繼續經營。第2天，眾多小賣家開始攻擊天貓。近7000名網友結集YY語音，有組織地對天貓的韓都衣捨、歐莎、七格格、依衣庫等幾個大賣家實施「拍商品、給差評、拒付款」的攻擊行為。天貓遭受嚴重損失，馬雲陷入困境。
騰訊立即發表聲明，敞開胸懷歡迎商戶入駐，並設綠色通道，提供億元營銷資源，承諾合作夥伴「不離不棄」；當當網也承諾短期內不會提高平台商家的收費標準；一些二線陣營的電商也向天貓商戶拋出了橄欖枝。
特立獨行的劉強東卻做出了反其道而行之的決定：京東向商戶最低收取10萬元保證金，而商品類商家最高要交50萬元保證金。
即使京東向商戶收取更高的保證金，人氣也仍然火爆。這不能不讓人看好京東的人氣以及京東的商戶質量。
劉強東站在高處，目光遠大，他預言：5年後，中國的綜合性B2C電子商務公司最多只能剩1—3家，而個品類垂直型電子商務公司會很多，但規模都不會很大。
一向把培養用戶作為頭等大事的劉強東認為，沒有自己用戶的電子商務公司是沒有價值的。電商要學會積累自己的用戶，創建自己的商城。
事實上，劉強東是對的。很多在淘寶網上做得不錯的賣家，成立了自己的B2C公司，但在尋找融資渴望做大的路上，遇到很多困難，因為他們的所有用戶都在淘寶平台上。淘寶旗下的大賣家要做強做大自己，必須買下域名，開始經營自己獨立的網店商城。淘寶的大賣家「檸檬綠茶」已經開了自己獨立的網上商城了。