大臣杜摯又說：「沒有百倍的利益，就不能改變成法；沒有十倍的功效，就不能更換舊器。倣傚成法沒有過失，遵循舊禮不會出偏差。」商鞅說：「治理國家沒有一成不變的辦法，有利於國家就可以不倣傚舊法度。所以湯武不沿襲舊法度而得天下，夏商不更換舊禮制而失天下。反對古制的人不能因此受到責難，沿襲舊禮的人是不值得讚揚的。」孝公說：「講得好。」於是任命商鞅為左庶長，終於決定變法。
言出必行
新法準備就緒後，還未公佈。商鞅就想：一定要想個辦法讓人們相信我的變法是真的！於是他在都城南門豎起一根三丈高的木頭，對圍觀的人說，誰能把它扛到北門去，賞黃金十兩。沒有人相信這是真的，自然也就沒有人去扛。後來商鞅把賞金一直加到五十兩，終於有一天，一個壯漢把木頭扛到了北門，商鞅當場賞了他五十兩黃金。借此表明令出必行，絕不欺騙民眾。老百姓紛紛議論：商鞅言而有信，他的命令一定要執行。隨後，新法終於頒告全國了。
新法在民間施行了一年，秦國老百姓到國都投訴新法不方便的人數以千計。正當這時，太子也觸犯了新法。商鞅說：「新法不能順利推行，就是因為上層貴族也觸犯它。所以不管是誰如果不遵守新法，一定要受到懲罰。」商鞅要依新法處罰太子，但太子是國君的繼承人，不能施以刑罰，於是商鞅就處罰了太子的兩位老師，因為他們的教導無方。公孫賈被處以黥刑（臉上刺字），公子虔再次犯法後處以劓刑（割去鼻子）；他還用殘酷的血腥手段進行鎮壓，僅一天就處死了七百餘人，以至於「渭水盡赤，號哭之聲動天地」。沒過多久，秦國人就都遵守新法，不敢抱怨了。新法推行了十年，秦國百姓這才體驗到新法帶來的好處，秦國出現了道不拾遺，山無盜賊，家家富足的局面。秦國人民勇於為國家奉獻，不敢為私利爭鬥，鄉村、城鎮社會秩序安定。當初說新法不方便的秦國百姓又紛紛到國都稱讚法令的好處。商鞅卻說：「這都是擾亂教化的人」，於是把他們全部遷到邊疆地區去。此後，百姓再沒人敢議論新法了，都遵紀守法老老實實地過日子。
商鞅伐魏
秦國富強之後，走上了對外擴張之路，商鞅也被任命為大良造為一職。商鞅曾勸孝公說：「秦和魏的關係，就像人得了致命的疾病一樣，必須得到根治不可，反正，不是魏國兼併秦國，就是秦國吞併魏國。為什麼這樣說呢？魏國地形險要，建都安邑，與秦國以黃河為界，獨自獲得崤山以東的有利地形。形勢有利時他們就向西進犯秦國，不利時就向東擴展領地。如今憑借大王的聖明賢能，秦國才能繁榮昌盛。而魏國剛剛被齊國打敗，諸侯們想背叛它，您可以趁此良機攻打魏國。魏國抵擋不住秦國的進攻，必然要向東撤退。魏國一退，秦國就佔據了黃河和崤山險固的地勢，向東就可以控制各國諸侯了。這可是統一天下的帝王偉業啊！」孝公認為有理，就派商鞅率領軍隊攻打魏國，魏國派公子卬領兵迎擊。
商鞅派人給公子卬送來一封信，寫道：「我當初與公子相處得很快樂，如今你我成了敵對兩國的將領。我不忍心相互攻擊，想與公子當面相見，訂立盟約，痛痛快快地喝幾杯，然後各自撤兵，讓秦魏兩國相安無事。」魏公子卬相信商鞅說的，就前去赴約。沒想到會盟剛結束，商鞅埋伏下的士兵突然將公子卬捉住，然後趁機攻打魏軍，徹底消滅了魏軍，才班師回朝。
魏惠王的軍隊多次被齊、秦擊潰，國勢一天比一天衰弱。他就派使者割讓河西地區奉獻給秦國以求和。魏國隨後離開安邑，遷都大梁。魏惠王懊惱地說：「我真後悔當初沒採納公叔痤的意見啊，否則也不會落得現在這麼悲慘的下場了！」商鞅得勝歸來後，秦孝公把於、商等地的十五個邑封給了他，封號叫做商君。
趙良的勸告
商鞅出任秦相十年，很多皇親國戚都因為他的變法剝奪了自己的世祿特權而怨恨他。一個名叫趙良的人去拜見商鞅，表示了自己對他的不滿。商鞅說：「我覺得我對秦國的治理成果是很顯著的，現在秦國社會道不拾遺，山無盜賊，家家富足，版圖也比以前擴大了許多，您有什麼抱怨的呢？」趙良說：「上古聖人虞舜曾說過：『謙虛的人才能被人尊重』，您不如遵循虞舜的主張去做，何必來問我呢？」商鞅說：「當初，秦國是何等落後，就像那未開化的野蠻夷狄，是我使他們懂得禮教，男女有別，國家富強。您看我與五羖大夫相比，誰更有才幹？」趙良說：「五羖大夫是楚國的鄉下人，聽說秦穆公賢明，就想去當面拜見，但卻沒有路費。他就把自己賣給秦國人做奴隸。整整過了一年，秦穆公才知道這件事，把他贖買出來，加以任用。五羖大夫出任秦相，勞累不坐車，酷暑不打傘，視察全國，沒有隨從的車輛，不帶衛士護從。他出任秦相六七年，就使秦國稱霸天下。他死時，秦國上下不論男女都痛哭流涕，連小孩子也感到悲傷，不唱歌謠了。您靠秦王寵臣的舉薦，才得以面見秦王，這就說不上什麼名聲了。您身為秦相不為百姓造福卻大建宮闕，這就說不上為國家建立功業了。您懲治太子的師傅，制定嚴刑酷法殘害百姓，這是積累怨恨、聚積禍患。教化百姓比命令百姓更深入人心。如今您卻違情背理採用嚴刑酷罰，這實際上不是對百姓施行教化啊！您一出門，後邊跟著數以十計的車輛，車上都是頂盔貫甲的衛士，您讓身強力壯的人做貼身警衛，持矛操戟緊隨在身後。這些防衛措施缺少一樣，您必定不敢出門。您的處境就好像早晨的露水，很快就會消亡。您要想延年益壽，就把商於封地交還秦國，到偏僻的地方澆園自耕，勸秦王重用那些隱居山林的賢才，教化百姓尊老愛幼，使父兄相互敬重，依功序爵，尊崇有德之士，這樣才可以稍保平安。如果您還要貪圖商於的封地，把獨攬國政視為榮耀，到時候一旦秦王去世，秦國想要報復您的人不計其數，您馬上就要命喪黃泉了。」