與袁世凱一樣，段祺瑞也喜歡羅致人才，其中最得他信任的，莫過於徐樹錚。
徐樹錚是江蘇蕭縣人，秀才出身。他和老段是一不沾親、二不帶故，原本只是老段手下的一名司書，不知怎麼就給老段賞識上了，送他到日本士官學校留學。小徐回國以後立刻扶搖直上，成為老段跟前的頭一名紅人。段府的人都說，老段起來得快是老袁一手提拔，而老段提拔小徐也像袁世凱當年提拔他自己一樣，甚至有過之而無不及。
譬如民國初年，老段做陸軍總長，徐樹錚就當次長，另外還有一個次長蔣作賓，可陸軍部裡的事大小都是徐樹錚說了算。不但蔣作賓當不了家，就連段祺瑞本人說的都不一定算數，因為小徐在老段面前是說一不二，從不被駁回;而老段吩咐下來的事，小徐卻不一定照辦。當時就有這麼件事，段祺瑞有個老部下被軍隊撤職了，窮得沒辦法來找老段，請求給個差使。老段看他可憐，就答應下來，並批交徐樹錚辦理。不料徐樹錚後來卻簽呈上去，說：「查該員無大用處，批駁，驗過」……於是這事就算拉倒。
小徐去段府，從來就是隨來隨見，用不著要號房的人通稟。段府的那些人，見了小徐都躲得遠遠的，因為大家都知道他脾氣大，又好挑毛病，惡狼惡虎似的，當面就給你一個下不來。倒霉時候小者挨一頓申斥，搞得不好，他跟老段一說，飯碗就被他砸了。旁人還有個靈活，但在徐樹錚這裡從來都是言不二價，所以大家都不願意沾他。
段祺瑞老段會客一般是在外客廳，但小徐一般是徑直走進內客廳，而且只談公事，三言兩語，交代完了就走。他很少參加公館的宴會，也不大陪著老段打牌，照例是公事公辦，態度很嚴肅。正因為如此，不但段府的人對徐樹錚抱著敬而遠之的態度，就是老段身邊的親信，那些軍政界的要人們也對小徐十分煩惡。有些事，大伙都避諱他，不願意讓他參加。為啥呢？因為只要一沾上徐樹錚，就得實行*，聽他一個人的了。
也許大家會覺得奇怪，為什麼老段會對小徐這麼信任呢？原來，小徐不但對老段忠心耿耿，一心護著老段，而且他這個人也真是有學問，有能力，才氣過人。小徐的記性也不是常人可比的，可以說是過目不忘。什麼公文啊條例啊，他看得既快，記得又熟，只要老段一問他，他總是能對答如流，誰要是不信，找出公文來一對，還真是一字不差。所以段府的人都說：「這是人家有才，你想，老頭子能不喜歡麼？」
據民國將領陳調元回憶說，他在任北洋第74混成旅旅長的時候，有一次來北京辦公事，在朋友做東的宴席上遇到徐樹錚。經朋友介紹後，徐樹錚便說已經看到他的公文，並將他要求補充多少槍、多少發子彈，及要多少軍餉等全部說出。陳調元聽後十分驚訝，因為他自己都沒有徐樹錚記得那麼清楚。數天後，陳調元到陸軍部拜訪徐樹錚，只見徐樹錚一邊與他談話，一邊還在批著公文，中間又有電話響起，徐樹錚拿起話筒聽電話，正當陳調元不自覺地把話停了下來的時候，徐樹錚向他示意：「沒關係，你繼續說。」這一次，陳調元算是見識了徐樹錚五官並用之能耐了。
徐樹錚的聰明，從小就有點名氣，據說他的老家徐州南關有位老先生象棋下得很好，自以為打遍天下無敵手，一時自負，竟把「將」釘死在棋盤上，說是沒人能把它撼動。徐樹錚聽說後，便去找他下棋，雙方在一陣猛烈廝殺後，老先生在徐樹錚凌厲的攻擊下，最後被逼得臨時找來斧頭起釘子，讓自己「將」能離開原位，一時被傳為笑談。那一年，徐樹錚才11歲。
有才歸有才，但天底下有才的人大都有個恃才傲物的臭毛病。袁世凱死後，段祺瑞做國務總理、徐樹錚做國務院秘書長的時候，就與黎元洪的總統府發生了激烈的矛盾衝突。
對於徐樹錚的專橫跋扈，黎元洪也是早有耳聞，最開始他是反對由徐樹錚出任國務院秘書長的，因為他知道徐樹錚這個人太難共事。後來老段托總統府秘書長張國淦和北洋*徐世昌代為轉圜，黎元洪這才勉強答應。不過，黎總統提出一個條件，那就是徐樹錚到總統府見他的時候，必須有張國淦陪同，他不單獨見徐樹錚。
由於當時約法對總統府與國務院之間的權限不甚了了，而老段和老黎在平日裡也不太互通聲氣，因此在一些事務上難免出現誤會與衝突。按照約法規定，國務院所決定的重大事件，應當呈遞給總統府，由大總統蓋印發佈。徐樹錚是國務院秘書長，因此經常要往返於國務院和總統府辦事，但這個小徐經常不給黎總統說明事件來由，只管催促總統趕快蓋印。要是黎元洪多問上幾句，小徐脾氣上來就敢當面頂撞。徐樹錚這種盛氣凌人的態度，若不是總統府秘書長張國淦從中斡旋調解的話，黎總統還真是有點吃不消。
有一次，徐樹錚拿著福建省三個廳長的任命書來請總統蓋印，黎元洪剛剛問了幾句這三人的從前來歷，小徐就不耐煩地說：「大總統問這些幹什麼？請趕快蓋印，我事情忙得很！」黎元洪被這麼一頂，當場被氣得半死。等徐樹錚走了，黎元洪恨恨地對手下人說：「我本不想要做什麼總統的，可你們看看，這些人目無總統到了什麼地步！」
徐樹錚非但不把總統府的人看在眼裡，就連國務院內部，他也是經常自作主張，凌駕於同事之上，譬如內務總長孫洪伊就與他發生過多次衝突。
孫洪伊是清末著名的立憲黨人，在民國初年的組黨熱潮中大出風頭，他此時與黎總統及馮副總統的關係打得火熱，自然免不了與老段、小徐發生矛盾。徐樹錚仗著老段的信任，在國務院一手遮天是人所皆知，偏偏遇到的孫洪伊也是眼高手低的朋友，為人爭強好勝，而且政治能量也不小，用當時人的話來說，這兩位在一起幾乎是「日日在火並之中」。
老孫是直隸人，年紀比小徐大十歲，哪裡看得慣小徐這個囂張勁。兩人的日常口角就不消說了，這裡說幾次大的衝突。第一次衝突是徐樹錚擅自以國務院的名義發佈調令、命廣東、福建、江西、湖南四省軍隊會剿護國軍李烈鈞部的事情引起。本來這事已經在國務會議上討論過，決議是去電調解，而小徐卻私自擬了一個*的命令拿給黎總統蓋印，結果被拒絕了。小徐一怒之下竟然擅自以國務院的名義將*之令發出，結果引起其他內閣成員的一片嘩然，孫洪伊當面指責小徐違法越權，而小徐也不甘示弱，兩人結下樑子。
緊接著，在八月下旬的時候，眾議院將湖南議員提出的一個議案轉給了國務院，其中對現任福建省長的胡瑞霖提出查辦要求，理由是其在任湖南財政廳長時有貪污等劣跡。胡瑞霖是皖系的人，徐樹錚接到議案後擅自以國務院的名義為胡瑞霖辯護，並將議案駁回。
孫洪伊得知後十分惱怒，他怒氣沖沖地找到老段說：「對民政長官的處分問題屬於內務部的職權，我自己分管的事情，我竟然一點都不知道，這算哪門子王法？如果秘書長可以包辦一切，那我這個內務總長還做它作甚？」
被這麼一鬧，老段也覺得這事做得荒唐，隨即命小徐將咨文追回，徐樹錚表面上答應，實際上卻不了了之。
一個月後，孫洪伊為整頓內務部，裁減了部裡的30多名職員。由於這些被裁者大都和北洋系的頭頭腦腦有著這樣或那樣的關係，他們豈能善罷甘休，而徐樹錚也想利用他們來把孫洪伊給搞下去，於是便慫恿他們向平政院上訴。結果，平政院裁定撤銷內務部原令，被解職的那些人仍舊回去上班。
平政院是袁世凱時期設立的一個政治仲裁結構，孫洪伊不但不接受這樣的裁定，反認為平政院是一個非法機構，隨後他擬將此案提交國會審議。徐樹錚害怕國會接受孫洪伊的意見，於是決定先下手為強，他在經過老段的同意後擬定了一道執行平政院裁決的命令，準備交總統府批准。
徐樹錚的這道命令，不但內務總長孫洪伊拒絕副署，黎總統也拒絕蓋印，府、院之間反覆爭執，釀成政治風波。老段自上次就對孫洪伊十分不滿，於是暗地裡給孫傳話，讓他辭職算了。但是，孫洪伊非但認為自己沒有錯，而且口氣十分強硬，拒不辭職。
老段這回真動怒了，他在十月中旬下了一道將孫洪伊免職的命令，讓小徐拿給黎總統蓋印。黎總統見後十分震驚，堅決不肯用印。徐樹錚為這事來回跑了四趟，黎總統連拒四次，絲毫不肯讓步。最後一次，徐樹錚威脅黎元洪說：「總統不肯蓋印也無妨，以後我們不准孫洪伊參加國務會議！」黎總統大怒：「你說的這是什麼話？！」徐樹錚冷笑道：「什麼話？這是段總理的原？！」
過了幾天，很少到總統府的段總理突然氣呼呼地出現在黎總統的面前，他拿著將孫洪伊免職的命令交給黎元洪，說：「總統要是不肯免孫洪伊的職，那就把我免職了吧！」
老段下了最後通牒，黎總統也只好退讓，不過他還想給雙方留點餘地，也給自己爭回點面子，於是他建議：「免職令還是不下的好，讓他自動辭職吧！我來給他做做工作！」
偏偏孫洪伊這位朋友是個死硬派，他死活不肯主動辭職，還大聲嚷嚷道：「什麼官我都可以不做，只要維持我的人格！我不辭職，不出洋，不外調！」
沒辦法，黎元洪只好把北洋系的大佬徐世昌請出來調解，最後孫洪伊和徐樹錚兩人同時被免職。
孔夫子曾經說過，「君子有三戒，少之時，血氣未定，戒之在色;及其壯也，血氣方剛，戒之在斗;及其老也，血氣既衰，戒之在得。」可惜的是，對於老夫子的這句話，大部分中國人都不曾認真對待，所以但凡有中國人，便有內鬥;內鬥不休，方是真正的中國特色呀。