1904年7月14日，麥克唐納和榮赫鵬率領步騎兵二千人（攜帶火炮八門）及後勤人員二千餘人，從江孜出發，向拉薩進犯。自江孜失陷後，西藏抗英鬥爭形勢發生了很大變化。西藏地方政府中的妥協勢力抬頭，終於向西藏軍民發出了停止抵抗的命令。噶倫降巴丹增放棄了指揮，再未進行有組織的抵抗。但西藏人民並沒有屈服，在卡羅拉、浪卡子等地，自動組織起來襲擊侵略者，給敵以重大殺傷。達賴幾次派代表要求英軍退回江孜談判，均遭榮赫鵬拒絕。7月25日，英軍抵達雅魯藏布江邊，達賴見大勢已去，遂將政務委託給噶勒丹池巴大喇嘛，自己前往青海。8月3日，英軍侵入拉薩。
英國侵略軍進入拉薩以後，到處燒殺搶劫，存於布達拉宮的各種珍寶、文物和宗教書籍幾被掠奪一空。侵略者的罪惡行徑，進一步激起西藏人民的心中怒火。拉薩各寺曾組織大批喇嘛，準備抗擊敵人，但因無人指揮而未成功。侵略軍不但面臨著可能再次出現的西藏人民的巨大反抗，而且還面臨著冬季大雪封山、補給更加困難的嚴重威脅。哲孟雄至拉薩沿途高山，9月初就開始下雪，因而9月中旬以前英軍必須撤出拉薩，否則就會被風雪所阻，孤軍難返。達賴出走後，榮赫鵬找不到談判對象，時間的拖延，對英軍十分不利。榮赫鵬曾自供說：「余在拉薩只許居留一月半乃至兩月，冬令前即須言旋。余既受此束縛，乃不得不加速進行條約之談判，而外表則仍行所無事，似有充分閒暇者。要之，余此時內慌怯而外鎮定」。又說：「余因期限短促，殊有進退維谷之慨。」１
但是，抱著「息兵求和」方針的清政府和有泰等人，不敢得罪英國侵略者，極力圖謀通過妥協忍讓的方法，盡快平息事端，這正好幫了英軍的大忙。就在英軍進入拉薩的第二天，有泰即親自到英軍營內，「以牛羊米面犒其士卒，及以禮物酬應辦事諸員」２，並向榮赫鵬表示，願意「協同工作，迅速努力於條約之完成」３。他嚴格限制和阻撓喇嘛和藏民的反抗，一再命令三大寺「不准再開兵釁」，並指令以噶勒丹池巴喇嘛為首的噶廈代表團出面與英軍談判。榮赫鵬見有泰如此軟弱無能，更加肆無忌憚。談判中，侵略者對藏方代表提出的公正要求，一概不予置理，叫囂「惟有接受我方之條件，否則惟有聽我繼續以武力壓迫」４。
1904年9月6日，西藏地方政府在英軍的威脅下，與英國侵略者在布達拉宮簽訂了喪權辱國的《拉薩條約》。由於文案何光燮的勸阻，有泰才沒有在條約上簽字。這項條約規定：開江孜、噶大克（今西藏噶爾雅沙）、亞東三處為商埠，向英國賠款五十萬英鎊，自印度邊界至江孜、拉薩一帶的炮台、堡寨一律削平，所有駐防軍隊全部撤去，西藏一切內政外交都要請示英國，他國不得干涉。根據這個條約，西藏實際上變成了英國的殖民地。
《拉薩條約》簽訂後，英國侵略軍於9月23日匆忙從拉薩撤走。
但是，該條約簽訂的消息一經傳出，立即遭到中國人民的一致反對。清政府迫於人民的壓力，也感到條約有損中國主權，令有泰切勿畫押。12月，清廷派外務部右侍郎唐紹儀赴印度與英國重新交涉。直至1906年4月，中英雙方於北京重新簽訂了《中英續訂藏印條約》。雖然英國取得了原《拉薩條約》中規定的許多特權，但新約中規定「英國國家允不佔並藏境及不干涉西藏一切政治」１，承認西藏是中國不可分割的一部分，從而使英國變西藏為殖民地的陰謀未能得逞。