戚繼光走進了廣東總兵官衙門。
陳瑞的好日子到頭了，戚繼光南調廣東，就是萬曆皇帝給這個兩廣總督的最後警告。早在萬曆八年，也就是1580年張居正在位的時候，萬曆就聽聞住在澳門的葡萄牙人擅自選舉首席法官，並在當地實施葡萄牙法律。張居正為此向他推舉陳瑞任總督兩廣之職，徹查葡萄牙人在帝國擅行司法大權一事。萬曆皇帝沒想到，陳瑞這一次反而將帝國的尊嚴出賣得乾乾淨淨，只好用張居正的這一枚棋子戚繼光來充當拿下陳瑞的釘子。
澳門一直是大明帝國的一塊心病。葡萄牙船長蘇薩（LeoneldeSousa）1556年１月寫信給葡萄牙路易斯親王，信中將葡萄牙人打入澳門的經?過描述得非常詳細。信中指出，葡萄牙人通過中國商人賄賂海道副使汪柏，並冒用他國名義，表示願意向大明政府繳納各種課稅，以尋求來廣東的貿易機會；汪柏於1553年上報北京朝廷，1554年獲批復准其貿易，從此葡萄牙人獲得了在澳門進行貿易的機會。
葡萄牙位於伊比利亞半島的西南部，也是歐洲最西端的國家，這個撮爾小國由於土地面積太少，一直通過不斷的海上擴張來實現其大國夢想。葡萄牙的皇帝們一個比一個熱衷航海，當貴族軍官達?迦瑪成功繞過好望角抵達印度之後，這個撮爾小國離東方大明帝國越來越近。在威尼斯旅行家馬可?波羅筆記的刺激下，葡萄牙人急於想從大明帝國獲取財富。第一個到達大明帝國的蘇薩通過行賄帝國官員，實現了貿易通商的第一步。
葡萄牙人在澳門的得寸進尺是有預謀的，他們航行全球的時候，所到之處無不燒殺搶掠，霸人財物，那位世界航海史上的牛人達?迦瑪在印度就幹過欺男霸女的醜事。葡萄牙人到了澳門，肚子裡的壞水又開始外冒。1560年，居住在澳門的葡萄牙人組織了包括三名最高長官：地方長官、大法官與主教的自治機構；更讓大明帝國蒙羞的是，這一自治機構規定：每一個在澳門出生的、具備法律資格的葡萄牙國王陛下的自由臣民，都有投票選舉的權利。來自葡屬領土其他地區的自由臣民，只要在澳門結婚或定居，也具有投票權，除非法律規定他們喪失資格。
葡萄牙人藉著貿易的借口，開始在王土上自己當家。這是何其猖狂！
市政委員們負責各類市政事務。法官們負責審查市議會通過的各項命令是否違反既定的規則和法律，也對民事、刑事案件作出判決，如有不服，起訴者可以向澳門的大法官上訴，或者向由六名部長組成的（包括大法官及由印度總督任庭長的）果亞最高法院上訴；在大多數情況下，果亞最高法院的判決是決定性的。檢察官負責稽核澳門的公共建築物，對應該進行的維修提出建議，並執行市議會的命令並代表澳門的葡萄牙人與香山縣令打交道。
更讓大明帝國生氣的是，葡萄牙人還在帝國的土地上收稅。葡萄牙在澳門的市政議會任命的財政官負責徵收澳門自治機構的年收入，其中大部分來自向葡萄牙商船徵收占貨物5％價值的商業稅。很多到港貨物沒有銷售，商人沒有現金繳納商業稅，財政官就讓商人用貨物抵稅，之後財政官再將貨物運到廣東等地出售，充實市政議會的財政收入。財政官每年要出席兩次市議會的會議，報告財政收支情況，一旦出現財政困難，市政議會就要向商人貸款，發動捐獻或徵收人頭稅和財產稅。
葡萄牙人是鐵了心要從大明帝國手上奪取澳門。他們不僅收稅，自治澳門，還在澳門僱用武裝士兵，最高行政長官都是擁有武裝部隊的商人，中日貿易船隊的大船長必須經?過葡萄牙國王任命，大船長也是武裝部隊的司令。當大船長的船隊往返日本途中停靠澳門的時候，大船長就是澳門葡萄牙人自治機構的最高長官兼武裝部隊司令官。澳門最高長官受制於葡萄牙殖民地印度果亞政府及里斯本葡萄牙中央政府。
澳門的市政議會讓大明帝國的官員發懵了很長時間，這些洋鬼子怎麼那麼怪異呢？在等級森嚴的大明帝國，長官就是父母，一切都是權力說話。葡萄牙人自己很快也被自己的小聰明弄懵了。由於中日貿易船隊需購入中國貨物及等候西南季風，要在澳門停留10個月到1年時間，加上嘉靖皇帝期間再度禁海，葡萄牙商船在中國的貨物採購往往無法在最佳的航行季節全部完成。第一撥到達澳門的船隊還沒有離開，第二撥就來了，這樣一來，澳門就出現了兩個甚至三個葡萄牙大船長，而規矩又是「大船長就是最高長官兼武裝部隊司令」，現在幾個一起現身，市政議會到底誰是真正的最高長官呢？
出大亂子是早晚的事。1564年，兩個大船長都抵達澳門，開始爭權奪利，急紅眼的兩位船長開始如潑婦罵大街。可能是葡萄牙人的原?始基因作祟，當年達?迦瑪到達印度，當地人嘲笑他運來的貨物低劣，這位爺曾一邊辱罵印度人一邊揮刀搶劫。現在兩位船長罵著罵著，覺得沒什麼意思。既然大家都有權調動部隊，乾脆來點男人的較量：動武。急紅眼的兩位大船長拉著各自的心腹要火並，這時天主教趕緊站出來充當和事佬，苦口婆心地告訴兩位船長，這是在大明的地盤上，你們兩個一旦火並，兩廣總督的大部隊開到澳門，我們都得滾蛋，你們自己好好想想後果吧。
兩位即將火並的大船長只得瞪著牛眼，在主教笑瞇瞇地教育下握手言和。這事很快就捅到葡萄牙國王那裡。這還了得，簡直丟人丟到家了，都是國王任命的大船長，怎麼到了澳門就火並呢？這個問題的更主要責任在國王那裡，是他將殖民權力賦予了商人。在利益面前，商人有了最高長官這件護身符，做生意的時候自然得心應手，最後賺錢最多的回國就能得到英雄般的禮遇，大船長在澳門不火並才怪。葡萄牙國王一生氣便下令：若遇到兩個以上大船長到達澳門的情況，由最早到達的大船長擔任最高長官執政。
葡萄牙人解決了內部矛盾，大明帝國的萬曆皇帝心裡卻仍不舒服。張居正在世時，就看不慣葡萄牙人在大明帝國的土地上當家。於是向萬曆皇帝保舉了陳瑞，命他總督兩廣。在1580年，陳瑞專程到廣東去處理葡萄牙人在澳門當家的事情。一到廣東，就給澳門最高行政長官香山縣令發了一個通知：讓香山縣令通知葡萄牙人，要澳門葡萄牙人的地方長官、大法官與主教到廣州解釋為什麼在中國的領土上，未經?許可便以他國而非中國的法律來管理澳門。
陳瑞的總督令讓葡萄牙人很搓火，如果依命令行事，有損葡萄牙人的尊嚴。如果不理這道命令，也不可以，因為那等於藐視總督的權威。陳總督一發火，數萬的大明帝國武士就將抽出刀劍驅趕在澳門的葡萄牙人。正在葡萄牙人左右為難的時候，西班牙駐馬尼拉總督郎基羅派遣耶穌會士桑切斯趕到了澳門，桑切斯帶來了一個讓葡萄牙人更為震驚的消息，海上霸主西班牙已經?強行將葡萄牙合併，現在葡萄牙所有人都要向西班牙國王腓力二世宣誓效忠。
澳門市政議會亂成一團，國家都滅亡了，澳門再不聽西班牙人的話，日子將很難過。為了向西班牙人表明自己的忠心，維護西班牙國王腓力二世的尊嚴，為西班牙打通中國的貿易通道，將澳門打造成為西班牙跟中國貿易的橋頭堡，葡萄牙人打探到了陳瑞的致命弱點：貪財。澳門市政會議決定派代表帶著大量財物去拜見陳總督。
1582年12月27日，代表主教的意大利傳教士羅明堅、首席檢察官彭瑞??代表最高長官等人到達兩廣總督統轄的兩廣交界處肇慶。傳播精神鴉片的傳教士利瑪竇有一個非常好的習慣就是寫日記，他將陳瑞召見羅明堅跟彭瑞??一行以及受賄的經?過描寫得惟妙惟肖：陳瑞是福建人，為人膽小、機智、視財如命，看見澳門葡商的財富，不禁垂涎三尺、深思染指。澳門市政議會為了對總督表示善意，加之怕他中斷兩國的交易，特別捐出了他們認為中國人最喜愛的物品當做見面禮，其中有中國人尚不能織的絲綢、打褶的外衣、水晶鏡，以及別的稀奇玩意兒，總共值一千兩銀子。
大鬍子利瑪竇給後世留下了非常珍貴的歷史鏡頭，簡直就跟實況錄像一般精彩：兩個葡萄牙代表受到很隆重的軍禮接見，目的是嚇唬他們而非歡迎他們。然而，當他（陳瑞）看到帶來的禮物，那威嚴的態度立刻改為和善，他含笑告訴葡萄牙人，殖民地的一切均可照舊，但是要屬中國官員管轄。這只是習慣性及形式性的聲明，因為澳門的葡萄牙人，一向都只遵守葡萄牙法律，別的國籍的人生活也很自由，即使是中國人，一旦成為教友，就會脫掉中國的衣服，改穿歐洲的衣服，其餘非教友的中國人，才屬於廣州政府所派的官員管轄。
陳瑞讓葡萄牙人前來肇慶受審的場面是多麼的壯觀，按照利瑪竇的日記，想像一下當時的場景：大明帝國帶刀武士雄赳赳地站立在衙門兩旁，迎風飄揚著帝國的旗幟。當葡萄牙人一行到來，帝國帶刀武士整齊劃一地行儀仗隊軍禮，冬日的暖陽照耀在武士珵亮的大刀上，刀光陰冷地反射到葡萄牙人的臉上，陳瑞坐在大堂之上，一臉嚴肅地望著漸行漸近的高鼻子藍眼睛葡萄牙人。葡萄牙人走到總督堂下，嘩啦一下將新奇玩意兒一字排開，陳總督頓時眼珠子都快掉出來了，那張胖乎乎的圓臉隨即如春風般和藹，綻放出如花笑靨。
陳瑞很失態，這正是澳門市政議會最想要的結果。
堂堂的兩廣總督見到鬼佬的稀罕玩意兒就變成了貪財鬼，連話都說不全。還一陣小跑地來到大堂之下，將葡萄牙人攙扶起來，左一個兄弟，又一個哥們地跟洋鬼子打成一片。利瑪竇極盡醜化之能事，把陳瑞完全描寫成一個死要面子的市井小人：眾目睽睽之下，陳總督還非常不好意思地對葡萄牙人說，不付錢堅決不能要東西。於是陳總督轉身問起每件東西的價值，並在隨侍面前以白銀支付。
利瑪竇一開始也很納悶，葡萄牙船長蘇薩在寫給路易斯親王的信中不是說大明帝國的官員貪婪成性嗎？陳總督怎麼突然變了呢？利瑪竇一點面子都沒給陳瑞留下，而是仔細研究了當時大明帝國的公務員法律條例，並終於弄明白了，陳總督這是在跟葡萄牙人假惺惺地演戲：《大明律》作為帝國最權威的法律明文規定，帝國官員收受賄賂，將受到嚴厲的懲罰。利瑪竇終於明白了，不是陳總督不想要，而是大明帝國禁止任何政府官員收受這樣的禮物。
利瑪竇筆下的兩廣總督完完全全就是一個小丑。在葡萄牙人送禮的時候裝模作樣不要，事後，又私下派人告訴葡萄牙的兩位代表，說見面時支付的那些銀子是為買第二批貨品用的，並且第二批貨品要私下交付給陳瑞本人。口口聲聲聖潔無瑕的傳教士羅明堅死心塌地地為葡萄牙人的殖民服務。不，現在應該是向西班牙腓力二世效忠。羅明堅一聽陳瑞代表的話，立即提出：既然陳總督收受了我們禮物，那麼為了長遠利益，就應該讓葡萄牙人長久居留澳門。
傳教士成為政治工具是十分可怕的一件事情。羅明堅一行到肇慶的主要目的就是為了葡萄牙人在澳門的居留權，現在陳總督貪婪成性，這點要求必定會答應。葡萄牙人現在已經?成為西班牙的臣民，而西班牙擁有當時世界上最先進的航海技術，海上艦隊正在緊鑼密鼓地建造當中，即使陳總督不答應，西班牙人的戰艦也會開過來，到時候陳總督能得到的就不是西洋的稀罕物，而是西洋火炮。羅明堅一臉陰笑地通過翻譯提醒陳瑞，如果陳總督答應葡萄牙人居留澳門，好處大大的有。如果不答應，我羅明堅學習中文已經?很久，對大明帝國的律法相當瞭解。
陳瑞精明過人，羅明堅的話明顯就是威逼利誘。
萬曆皇帝憤怒?陳瑞讓帝國蒙羞。葡萄牙萬里之遙，從來沒有向大明帝國納貢，當年鄭和率領萬國公使向成祖永樂皇帝朝拜的時候，也沒有聽說有葡萄牙鬼佬的存在。這一次本是讓陳瑞調查在澳門的葡萄牙人自治的問題，沒想到陳瑞不僅將澳門的統治權交給了蠻夷，還用軍樂隊歡送這幫化外之民，更為丟臉的是，陳瑞身為兩廣總督，還親將這幫葡萄牙來的商人送到碼頭。
羅明堅的話就是暗示陳瑞已經?收受了葡萄牙人的賄賂。按大明律法，一千兩銀子可是特大的貪墨案，那是要下大獄抄家問罪的，皇帝老兒一不高興，總督的人頭也可能懸掛午門。陳瑞苦笑著答應了羅明堅的威脅。利瑪竇畢竟不是中國人，在自己的日記中寫道：總督好像很高興。利瑪竇哪裡知道陳瑞已經?一失足成千古恨，上了羅明堅、葡萄牙人的賊船，不，是西班牙人的，這可是出賣帝國主權的大罪。利瑪竇將陳瑞的賣國行徑進行了詳細的刻畫：在接見終結的時候，陳瑞交付了白銀，又給了葡萄牙代表很多不同的食物。最後，以隆重的禮節送他們上船。前有樂隊開道，後有官員護送，浩浩蕩蕩地經?過市區來到碼頭。
利瑪竇在日記裡臨了來了一句畫龍點睛的總結：財富對人誘惑之大，可見一斑。西班牙人在攻伐歐洲大陸、美洲大陸之後，將貪婪的目光投向了神秘的東方，當年鄭和下西洋滿船珍寶的傳說更讓西班牙人垂涎不已。現在，葡萄牙人給西班牙人搭建了最快捷的澳門跳板，16世紀的歐洲雄主西班牙國王腓力二世在遭遇美艷絕倫的英國女王無情戲耍之後，終於登上了大明帝國的土地，澳門從此以後很長一段時間被西班牙人了。
澳門是大明帝國的黃金港口：
廣州—澳門—果阿—里斯本歐洲航線。這是葡萄牙人於1553年進入澳門和租居澳門後開闢的航線，全長11890海里。
廣州—澳門—長崎航線。這是葡萄牙人進入澳門後開闢的東方航線。
廣州—澳門—望加錫-帝汶航線。這是廣州與東南亞國家的古航線，鄭和下西洋後進一步開發。
廣州—澳門—馬尼拉—拉丁美洲航線。這是1575年（萬曆三年）開闢的新航線，終點到達墨西哥的阿卡普爾科（Acapulco）和秘魯的利馬（Lima）港口。
大明帝國在嘉靖皇帝期間再度禁海，將浙江、福建的貿易港口關閉，獨留廣州市泊司，廣州市泊司委託三十六行出面代理對外貿易。從嘉靖皇帝禁海到萬曆皇帝當政，張居正再度擴大貿易規模，作為貿易執照的船引由每年的幾張擴大到每年100張。貿易規模的擴大，讓廣州港口的貿易發生了?-天覆地的變化，從嘉靖禁海到萬曆皇帝獨掌朝政，廣州市泊司統計的貿易額達到上億兩白銀。
葡萄牙人賴在澳門不走，甚至打起自治澳門的算盤，就是看準了澳門在大明帝國的貿易地位。澳門一直是廣州連通海外的中轉貿易港口，甚至可以說，廣州港口的財富都是通過澳門口岸實現的。葡萄牙人只要坐在那裡收商業稅，就可以從大明帝國的身上刮走數百萬兩銀子。現在西班牙人成了葡萄牙的主宰，腓力二世更不會放過澳門這塊肥肉。
年輕氣盛的萬曆皇帝在乾清宮咬牙切齒，澳門的主權喪失，自己有何顏面去見列祖列宗？成祖永樂皇帝的氣魄在自己的手上消失殆盡，這都怪張居正給自己推薦的好人，堂堂的兩廣總督居然拜倒在鬼佬商人的小玩意兒腳下。陳瑞，你等著，你的好日子到頭了。萬曆皇帝聲嘶力竭地怒?吼道：「給我下獄！抄家！」