1784年11月25日，潘振承還沒有趕到東印度公司廣東管理委員會，一個噩耗便傳來，被炮擊的傷者死了。
血案變成了命案，事情越來越複雜，潘振承已經沒有太多的時間去琢磨背後所謂的陰謀，眼下穆騰額是要皮古交出兇手。在穆騰額秘書的監督下，潘振承帶領著黃埔港的行商們，一行人穿著官服，浩浩蕩蕩地走向東印度公司廣東管理委員會。管理委員會的人一通報，皮古壓根就沒有在管理委員會。原來皮古擔心廣東巡撫孫士毅不分青紅皂白抓走自己，那樣管理委員會就亂成一團，今年的貿易就沒法做了。
潘振承現在必須找到皮古，否則沒法跟穆騰額交代。穆騰額現在希望命案能在粵海關解決，一旦兩廣總督孫士毅插手，那問題就更複雜了。潘振承跟管理委員會交涉，表示見不到皮古，穆騰額就不讓行商們跟洋鬼子做生意，也不會發放出港牌照，到時候大家都做不了生意，管理委員會的一名委員這才答應帶行商們找皮古。
穆騰額已經跟秘書交代過，跟皮古等人談話一定要小心謹慎，尤其是1780年絞死法國人之後，洋鬼子對交出兇手很是忌憚，他們意識裡認為只要交出兇手，不經過任何審判程序，中國官員就憑著殺人者死的觀點，將洋人給殺了。潘振承一行很快就見到了皮古，穆騰額的秘書盡量控制自己的情緒，調整自己說話的語氣，希望皮古能夠交出「休斯夫人」號的炮手，只要將炮手帶到廣州巡撫衙門審訊，一切生意照常。當然，新來的巡撫孫士毅兼署兩廣總督，是一位進士出身的文人，剛剛為乾隆皇帝編撰完《四庫全書》，乾隆皇帝很高興，就讓這位進士文人來到廣東，孫巡撫非常注重禮數綱紀，所以一定會按照程序審理命案的。
皮古這個人非常多疑，儘管穆騰額的秘書費盡口舌，表示不要將命案擴大化，可是這位管理委員會的主任依然不太信任大清帝國的官員。皮古自認為炮手已經逃匿，現在海關衙門是一定要拿人的，那麼管理委員會只能找一個替身去滿足海關衙門，甚至是滿足巡撫衙門。皮古希望能夠用替身的方式讓巡撫衙門開庭審理，可一旦交出替身，替身的安全問題基本得不到保證，完全有可能不經審理就被殺頭。
一個更為不幸的消息讓皮古如坐針氈，受炮擊重傷的另外一個中國人，就在潘振承一行跟自己交涉的時候，也死了。第二個人的死讓中國人越來越憤怒，死亡的信息快速地傳到了巡撫孫士毅的耳朵裡。孫士毅立即派人給穆騰額傳話，一定要將炮擊的兇手抓住，如果英格蘭人不交出兇手，一切後果將由英格蘭人自己負責。
皮古現在越來越感到這件事棘手，對潘振承一行施行拖延戰術。
11月25日晚些時候，皮古給海關衙門一個明確的答覆，「休斯夫人」號不是東印度公司的船隻，管理委員會不能對這艘商船負責，所以也就不能交出炮手。穆騰額聽到皮古的話眼珠子差點兒沒掉出來，立即派出自己的秘書，一定要讓皮古交出兇手。潘振承跟穆騰額的秘書再次找到了皮古。
皮古非常無奈地告訴潘振承一行：「我們對我國的私商船是無權過問的，因此在這個問題上，『休斯夫人』號的大班喬治?史密斯，比我們更適合於去滿足你們的要求。」皮古最後拋出一句話：「我們只做調解人，假如你們願意保證在商館審訊一個人而不會有更多的要求，我們可以勸說喬治?史密斯把一個人交出來審訊，其他的事，都不在我們的權限之內。」
英格蘭人簡直就是拿穆騰額開心，在中國審訊嫌疑犯從來都是在官府衙門，沒有聽說過在商館進行審理的。千百年來，公堂之外審理都是濫用私刑，無論是在法律上還是老百姓，都不會承認審判結果。英格蘭人炮擊打死中國人，居然還跟中國官府討價還價，審判地點都要在商館，蔑視中國法律以及主權尊嚴到了極致。皮古甚至厚顏無恥地提出交出一個人，皮古說的這個人一定是替身，難道在英格蘭有人犯罪了就可以交出一替身了事？太荒唐可笑了。
皮古覺得交出一個人替代炮手去接受中國政府審判，這樣的事情在他看來並不奇怪，而且是非常普遍的做法，並且他已經見過這樣的處理辦法。看樣子英格蘭殖民者打著公正、法律的幌子，沒有少幹過違法甚至違背人倫的勾當，替身的命在他們的眼裡就不是命，甚至可以拿一筆錢去買來。潘振承告誡皮古，現在英格蘭人殺死的是中國人，並且炮手已經跑了，人也死了，大家都知道怎麼回事，還用替身是不可能的。
潘振承明確地告訴皮古：「中國官員一直對生意人很歧視，在讀書人眼裡，商人跟妓女差不多，所以生意人有錢了都喜歡買個官銜，肯來商館的官員品級都是很低的，低品級的官員沒有資格審判這樣的命案，所以兇手一定要到廣東巡撫衙門的公堂去審理。退一步講，只要炮手被帶到商館，南海縣的縣令就會命令衙役將兇手帶走。」
皮古一聽南海縣令要派衙役到商館拿人，馬上就搖頭，堅決抗議潘振承一行將官兵帶到商館，那樣一來整個歐洲商人都會很震驚。一旦這樣的先例一開，以後廣東的衙門隨時都可以到商館抓人，這樣一來歐美商人的安全就得不到保障。皮古甚至威脅潘振承：「如果你們堅持自己的觀點，事情就無法解決，因為我們不能把任何人放在我們覺得會發生危險的狀態之下。」洋鬼子的邏輯是多麼的荒唐，他們殺人之後，居然擔心廣東巡撫審判兇手是危險的，洋鬼子的命難道就比中國人的金貴？
兇手沒有拿到，孫士毅生氣了，派出南海縣令親自出馬抓人。
26日晚上11點，英格蘭人已經睡了，潘振承帶著南海縣令以及幾個跟班，摸黑來到了皮古睡覺的商館。皮古對縣令深夜的突然造訪很驚訝，不過縣令告訴皮古，官方暫時不想動用武力，現在案子還沒有查清，所以待在商館的喬治?史密斯不能離開廣州逃跑，在這三四天內一定要待在商館，方便官府問話。
孫士毅一看喬治?史密斯這老小子乖乖地待在商館，心想：跑了和尚跑不了廟，只要抓住這傢伙，自然就能抓住開炮的炮手。當天晚上，孫士毅簽了秘密逮捕令。27日，天還沒有放亮，南海縣令就帶著一幫衙役圍在商館周圍，然後派出一人充當潘振承的夥計，這夥計告訴喬治?史密斯，說潘老闆有信給他。喬治?史密斯在被窩裡睡得熱熱乎乎的，以為潘振承的信是給自己出主意開溜。衣服都還沒有來得及穿好的喬治?史密斯就光著腳丫子就跑來開門，衙役們一哄而上，將喬治?史密斯五花大綁給押走了。
喬治?史密斯被逮捕的消息迅速傳遍了黃埔港，皮古開始煽動歐洲人團結起來，要歐洲商人們跟中國政府對抗，以確保歐洲人在黃埔港的安全。穆騰額聽到這個消息，立即派兵丁把守住通往碼頭的道路，下令停止廣州與黃埔港之間的一切往來。英格蘭人陷入恐慌之中，通事、行商都關門在家摟著小老婆親熱去了，不想管英格蘭人的爛事。
孤立的皮古開始聯絡歐洲以及美洲商人，說在英格蘭的法律下，一個人犯法，由本人負責；但是中國的習慣跟法律卻不一樣，中國有株連的法律，一旦某個人犯罪，他的親屬同僚都可能承擔連帶責任，甚至皇帝不高興了，可能十族都要被殺光。皮古這一煽動，黃埔港的洋鬼子陷入了恐慌狀態，尤其是兵丁包圍了所有商館，貿易也全部停止，這樣一來洋鬼子都被捲入了命案的漩渦。
恐慌中的洋鬼子並沒有立即站到皮古一邊。穆騰額非常惱火皮古的行為，這個軟硬不吃的傢伙是鐵了心要跟自己鬥到底。那好，就讓把守的兵丁將各國商館分割開來。穆騰額的舉動給了皮古一個更好的煽動理由：「你們哪一位敢說現在自己是安全的？按照中國人的思維習慣，以及他們野蠻的法律，每一個人隨時都可能被指控，要為他的同僚或者下屬承擔連帶責任，當然首先牽連的是英格蘭人，可是英格蘭商船上有法國、美國的僱員，這樣一來，這樣的株連就會蔓延到整個歐洲以及美洲商船。」
法國人、美國人、荷蘭人、丹麥人迅速被皮古的煽動動搖了，都摒棄前嫌，團結起來支持英格蘭人。歐洲人跟美洲人的行動很快令廣東巡撫孫士毅震驚：洋鬼子下令各船將駁艇配備人員武裝起來，洋鬼子們都扛著長槍火炮，直奔英格蘭人的商館。歐洲人甚至命令兩艘停在廣州的駁船開出。但是海關軍隊已經封鎖了交通，歐洲人甚至叫囂：「當前不是拘守細節的時候，將舢板船配備人員並武裝起來。」
孫士毅已經意識到問題正在惡化，劍拔弩張的黃埔港成了一個火藥桶。一旦歐洲人的舢板船集結到黃埔港，荷槍實彈的歐美人完全可能在黃埔港打垮粵海關的部隊，這樣一來就不是兩個人的命案那麼簡單。孫士毅馬上派出快馬給穆騰額送信，讓穆騰額告訴東印度公司廣州管理委員會，喬治?史密斯是去廣州配合調查，很快就被送回來。
皮古已經掌握了準確信息，歐美的舢板船武裝很快就能開到黃埔港，只有對粵海關以及廣東巡撫進行武力施壓，才能確保喬治?史密斯的絕對安全，也才能教訓中國人，讓他們以後不能隨便逮捕違法亂紀的歐美人。皮古認為穆騰額捎帶的巡撫口信只是為了平息黃埔港的騷動，這是廣東巡撫孫士毅爭取時間調動軍隊的詭計。
歐美商人的舢板船在江面上呼嘯而至。粵海關的水師部隊警告歐美舢板船，希望他們能夠克制，不要硬闖巡邏船的封鎖線。而激動的歐美舢板船把帝國水師部隊的警告當成耳邊風，他們不顧一切突破封鎖線，甚至對著攔截他們的水師巡邏船直衝過來。水師巡邏船在警告無效的情況下，向舢板船開槍射擊。在黃埔港外圍，帝國水師巡邏船跟歐美舢板船進行了猛烈的交火，舢板船上已經沒有重武器，火力上佔不到優勢，帝國水師巡邏船也是老套的火槍，雙方糾纏到晚上11點，歐美舢板船武裝人員才趁天黑趕到了黃埔港。黃埔港的空氣完全被緊張的對峙凝固，戰爭一觸即發。
孫士毅震怒了，馬上寫了命令傳到粵海關。
穆騰額現在已經是焦頭爛額，粵海關軍隊接管之後，歐美商人已經完全團結在一起了。貿易已經停止了，一旦僵局繼續，甚至惡化，黃埔港硝煙瀰漫的那一天，也就是穆騰額抄家問斬的那一天。現在粵海關是帝國唯一的對外窗口，也是內務府跟皇帝的錢袋子，錢袋子沒有了，自己的人頭恐怕也就沒有了。
孫士毅的手諭措詞強硬。按照現在黃埔港的處境，一旦孫士毅的手諭公佈，更會引起洋鬼子的反彈。現在兩廣總督又換人了，新任兩廣總督舒常屁股還沒有坐熱，乾隆皇帝就將舒常調回北京擔任工部尚書，新委派的兩廣總督還沒有到任，孫士毅就暫時代理兩廣總督，現在孫士毅可以說是兩廣地界上絕對的一把手，他的手諭還是要執行的。
現在碼頭處於戒嚴狀態，中國商人都紛紛躲了起來，怎麼樣才能把孫士毅的手諭傳達給洋鬼子呢？最後穆騰額只有派一個下屬到碼頭上去溜躂，假裝散步，這樣一來洋鬼子也不會懷疑，對方也不會開火。洋鬼子見有海關衙門的人到碼頭上來散步，趕緊想法子接近。海關衙門的官員從來就沒有真正將洋鬼子當人看過，看到洋人就高昂著頭。
廣東巡撫兼署兩廣總督孫士毅諭令英格蘭人頭目及其餘英格蘭人知照：船長威廉姆斯的船開炮時，殺死本地居民一人，無論是有意或無意，此人必須出庭受審，以符體制。現已逾三天，爾等仍未將該炮手送來，足以證明爾等有違法令，為慎重起見，仍將喬治?史密斯扣押城內，彼已允去函黃埔，要求該炮手出庭受審，該炮手到後，立即將喬治?史密斯送回。
孫士毅的諭令本已將政府的態度說清楚，可能是他對洋鬼子武裝駁船到黃埔港的行為非常生氣，在諭令的結尾，孫士毅的態度突然異常強硬：本官勸令爾等安分守己，並遵從本諭令，不得有任何違抗表示，如爾等拒不遵令，本部院即令兵勇沿河直至虎門排列槍炮，堵塞爾等退路，必使爾等遵照律令而後已。爾等試想有何力何能，敢於違抗干犯我朝法令，爾等應再三思之。勿貽後悔莫及。
現在沒有人能夠理解孫士毅的壓力。孫士毅這個人仕途非常坎坷。乾隆二十六年中進士，從知縣、內閣秘書開始幹起，好不容易熬到了雲南巡撫。雲貴總督李侍堯的貪污案爆發，乾隆皇帝對身為雲南巡撫的孫士毅居然沒有揭發李侍堯非常不爽，馬上把他的巡撫官帽給免了，還發配到新疆伊犁。孫士毅在伊犁幾年，乾隆皇帝聽說他很清廉，於是調他回北京編撰《四庫全書》，《四庫全書》編完，乾隆皇帝才讓孫士毅外出為官，出任山東布政使。這一次很快調任廣西巡撫，不到一年工夫又調任廣東巡撫。就在黃埔港命案前，孫士毅捲入了一場驚天大案。